Nasceu em Ermenek, Turquia, em 1974. Formado em economia e história na Universidade Bogazici-Istambul, Alper é doutor em história moderna turca. Realizou os longas-metragens Beyond The Hill (2012), premiado na seção Fórum do Festival de Berlim; Frenzy (2015), que recebeu o Prêmio Especial do Júri no Festival de Veneza; e O Conto das Três Irmãs (2019). Emin Alper também trabalha como programador artístico da recém-fundada Cinemateca de Istambul.